Matematické Fórum
Nevíte-li si rady s jakýmkoliv matematickým problémem, toto místo je pro vás jako dělané.
Nástěnka
❗22. 8. 2021 (L) Přecházíme zpět na doménu forum.matweb.cz!
❗04.11.2016 (Jel.) Čtete, prosím, před vložení dotazu, děkuji!
❗23.10.2013 (Jel.) Zkuste před zadáním dotazu použít některý z online-nástrojů, konzultovat použití můžete v sekci CAS.
Nejste přihlášen(a). Přihlásit
#1 11. 10. 2014 15:02
celkový náboj peptidu
Dobrý den,
prosím o pomoc s tímto příkladem:
Odhadněte celkový náboj peptidu při pH 5 a při pH 9.
Arg His Gly Phe Gly Glu Lys Tyr Cys Ala
Hodnoty pKa koncových disociabilních skupin jsou:
pKa1=3,6, pKa2=7,9
Vůbec nevím, co s tím mám dělat, jen to, že se to dělá přes izoelektrické body.
Předem moc děkuji.
Offline
#2 11. 10. 2014 20:19 — Editoval Olaf11 (11. 10. 2014 20:25)
Re: celkový náboj peptidu
↑ Fčela:
Ahoj,
zacni s tim, ze se podivas, jak kazda z tech aminokyselin vypada pri danem pH (5 a 9).
(i) U N-koncove kyseliny (tj. prvni AMK v zapise - arginin) nepocitej naboj karboxy skupiny, pres kterou se napojuje na histinin, (ii) u C-koncove kyseliny (tj. posledni kyselina v zapise - alanin) nepocitej naboj amino skupiny, pres kterou se napojuje na cystein, (iii) u kyselin, ktere jsou mezi okrajovymi pocitej pouze naboj postrannich skupin (protoze jak alfa karboxy, tak amino se zapojuji do peptidovych vazeb).
No a celkovy soucet plusek a minusek (plus pricitam jednicku, minus odecitam jednicku) ti da tvuj odhad celkoveho naboje peptidu pri danem pH.
Je to asi snazsi zapsat si to do tabulky, pokud se ti zda neco nejasne, tak dej vedet tady na foru a ukazu ti to cele, ale melo by ti to jit snad bez problemu ;-).
Jen pro jistotu napoveda, kdyz by -COOH skupina mela pKa = 2.0, pote 'jeji naboj' bude vypadat na zaklade pH nejak takto:
pH 0-2.0 .. 2.0<
naboj 0 .. -1
( -COOH .. -COO(-) )
Tohle udelas pro kazdou skupinu tech aminokyselin (podle toho, jak jsem popsal vyse), ktera muze nest v danem peptidu naboj a jen pote sectes kolik tam tech naboju vlastne mas s tim (tj. kdyby v mnou uvedem pripade byla -COOH skupina v postrannim retezci dvakrat, tak pri pH mensim nez dva bude celkovy naboj roven (0+0 = 0) a pri pH vetsim nez dva bude celkovy naboj (+1+1 = +2).
Posledni napoveda skryta
Offline